Bei Cranio werden die Veränderungen nicht von außen eingebracht, sondern es werden die Bedingungen geschaffen, dass der Organismus selbst Veränderungen vornehmen kann (Autoregulation). Die therapeutische Wirkung kommt also durch körpereigene Mechanismen zustande.

Durch die Behandlung entsteht im Organismus ein Reaktionsmuster für den Umgang mit bestehenden Problemen. Dieses Reaktionsmuster ist somit bekannt und kann immer wieder verwendet werden. Je öfter es als erfolgreich „abgespeichert“ wird, desto stärker wird seine Präsenz. Die Cranio-Behandlung hinterlässt also eine Kompetenz zur Selbstheilung.